使用64位索引编译Octave(GNUOctave(版本10.1.0))

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E.3使用64位索引编译Octave¶

注意:以下内容仅适用于具有64位指针的系统。使用配置Octave--enable-64不能神奇地使32位系统具有64位地址空间。

在64位系统上,默认情况下,Octave使用64位整数对数组进行索引。如果配置脚本确定BLAS库使用32位整数,则使用以下库的操作仅限于维度小于的数组2^{31}元素:

BLAS
LAPACK
QRUPDATE
套件解析
日晷IDA
ARPACK

此外,以下库使用int在内部,somaximum问题的大小总是有限的:

GLPK
Q船体

除了GLPK和Qhull,这些库也可以配置为使用64位整数,但大多数系统不提供以这种方式构建的软件包。如果您希望使用大型数组进行实验,以下信息可能会有所帮助。

要确定的整数大小BLASOctave使用的库,可以执行以下代码:

clear all;
N = 2^31;
## The following line requires about 8 GB of RAM!
a = b = ones (N, 1, "single");
c = a' * b

如果BLAS库使用32位整数,将引发错误:

error: integer dimension or index out of range for Fortran
INTEGER type

否则,如果BLAS库使用64位整数,结果为:

c = 2^31 = 2147483648

请注意,如果a和b不是从赋值的a = b = …。进一步注意,数据类型single具有大约23个二进制位的精度。在这里的特定的例子中,没有舍入误差soccur。

通常,最好将所有这些库的版本都支持32位索引,或者所有这些库都必须支持64位索引。将64位索引库与32位索引库混合使用可能会导致不可预测的行为,包括可能丢失数据的程序崩溃。

以下说明是在x86_64 Debian系统上使用Octave和GCC 4.3.4的开发版本进行测试的,现在可能已经过时。请返回Octave错误跟踪器上的任何问题或更正。

下面列出的版本是用于测试的版本。如果这些包的新版本可用,您应该尝试使用它们,尽管可能存在一些差异。

所有库和头文件都将安装在的子目录中$prefix64(您必须选择此目录的位置)。

BLAS和LAPACK (http://www.netlib.org/lapack)
两个库的参考版本都包含在参考中LAPACK 3.2.1赋值自http://www.netlib.org/.
- 复制文件make.inc.example并命名make.inc。参数-fdefault-integer-8和-fPIC(在64位CPU上)必须添加到变量OPTS和NOOPT.
- 编译完此库后,请确保使用它来编译Suite sparse和Octave。在以下内容中,我们假设您安装了LAPACK 库为$prefix4/lib/liblapack.a。
QRUPDATE(https://sourceforge.net/projects/qrupdate)
在Makeconf文件
- 添加-fdefault-integer-8到FFLAGS.
- 调整BLAS和LAPACK 如果您的64位感知BLAS和LAPACK 依赖库位于非标准位置。
- 设置PREFIX到安装树的顶级目录。
- 跑make solib以创建一个共享库。
- 跑make install以安装库。
套件解析(http://faculty.cse.tamu.edu/davis/suitesparse.html)
将以下参数传递给make启用64位整数BLAS库调用。在64位Windows系统上,使用-DLONGBLAS="long long"相反
```
CFLAGS='-DLONGBLAS=long'
CXXFLAGS='-DLONGBLAS=long'
```
Suitesparse生成文件不会生成共享库。在某些系统上,您可以通过执行以下简单操作来生成它们
```
top=$(pwd)
for f in *.a; do
  mkdir tmp
  cd tmp
  ar vx ../$f
  gcc -shared -o ../${f%%.a}.so *.o
  cd $top
  rm -rf tmp
done
```
其他系统可能需要不同的解决方案。
日晷IDA(https://computing.llnl.gov/projects/sundials/ida)
使用配置时cmake添加标志位-DSUNDIALS_INDEX_SIZE=64.
ARPACK(https://forge.scilab.org/index.php/p/arpack-ng/)
- 添加-fdefault-integer-8到FFLAGS当运行configure时。
- 跑make建造依赖库。
- 跑make install以安装库。
ATLAS而非参考BLAS和LAPACK
欢迎就如何编制ATLAS提出建议。
GLPK
Q船体(http://www.qhull.org)
二者都GLPK和Qhull使用int内部,因此最大问题大小可能受到限制。
八度
Octave的64位索引支持通过configure参数激活--enable-64.
```
./configure \
  LD_LIBRARY_PATH="$prefix64/lib" \
  CPPFLAGS="-I$prefix64/include" LDFLAGS="-L$prefix64/lib" \
  --enable-64
```
您必须确保除liboctave/external/ranlib目录被编译为INTEGERS为8字节宽。如果您使用的是gfortran,配置脚本应该自动设置Makefile变量F77_INTEGER_8_FLAG 到-fdefault-integer-8。如果您正在使用另一个编译器,则必须自己设置此变量。您不应该在中设置此标志位FFLAGS,否则中的文件liboctave/external/ranlib将被破解。
其他依赖项
对于以下依赖项,可能不需要做任何特别的操作。如果你查找确实需要做一些事情,请提交一份错误返回。
- pcre
- zlib
- hdf5
- fftw3
- 卷曲
- GraphicsMagick++
- OpenGL
- 自由型
- fontconfig
- fltk